Неуведомление ФМС

Добрый день. Нужна Ваша консультация .

ИГ Украины (свидетельство о предоставлении врем убеж. + врем регистрация) принят в организацию в феврале 2015 года. В процессе трудовой деятельности приобретает статус РВПрож. на 3 года (август 2015). На сегодня (июнь 2016) он отказывается от Свидетельства о предоставлении убежища и далее трудится по паспорту ИГ с отметкой о РВПрож. до 2018г. О его приёме организация неуведомила ФМС (ввиду не знания 115-ФЗ и закона о беженцах). Можно ли считать срок привлечения к ответственности прошедшим или же переживать дальше? И поскольку ИГ Украины отказался от врем.убежища, но сохранил статус РВПрож., надо ли его уволить и потом опять принять? Или здесь просто доп.соглашение к Трудовому договору с изменениями? В ФМС настоятельно рекомендуют уволить и принять, ссылаясь на то, что у него изменился основной документ. Спасибо.